小儿脑瘤中的 TERT 超甲基化
2013-05-22 11:12:05   来源：37度医学网   作者：  评论：0 点击：

背景
小儿神经肿瘤学的主要目标是识别恶性肿瘤的稳健生物标志物和能够确定疾病进展的方法。 我们调查了在小儿脑瘤中，TERT 启动子的甲基化能否作为恶性肿瘤和患者预后的生物标志物。

方法
我们在发现队列中使用的是从德国癌症研究中心（德国海德堡）获得的小儿脑瘤患者样本和脑组织正常的个体样本。 我们使用甲基化阵列对 DNA 进行了全基因组评估。 我们在验证队列中使用的是从多伦多的两所医院（加拿大安大略）获得的具备完整临床和随访数据的若干组织样本。 我们采用定量 Sequenom 和焦磷酸测序法对 TERT 启动子的已识别区域进行了甲基化分析。 我们通过实时 PCR 评估了 TERT 表达。 为了确定能否使用该生物标志物来评估并预测进展，我们分析了配对的肿瘤（从低分级向高分级转化、从局限性向转移性转化的肿瘤，以及不同分级的脉络丛肿瘤）样本中的甲基化情况。 最后，我们调查了在识别区域发生或未发生超甲基化的后颅窝室管膜瘤患者的总生存率。 所有负责检测的人员均不知道患者预后。

结果
我们对发现队列中的 280 个样本进行了分析，并识别了一个 CpG 位点 (cg11625005)，其中，在来自正常脑组织和低分级肿瘤的 79 例样本中，有 78 例 (99%) 未发生超甲基化，但在来自恶性肿瘤的 201 例样本中，有 145 例 (72%) 发生了超甲基化（甲基化 >15%；p<0·0001）。 我们对验证队列中的 68 个样本进行了分析，并识别出一个由五个 CpG 位点组成的亚群（以下以“转录起始位点的上游 [UTSS]”代表），该亚群在所有表达 TERT 的恶性小儿脑瘤中均发生超甲基化，但在不表达 TERT 的正常组织中并非如此 (p<0·0001)。 UTSS 的阳性预测值为 1·00 (95% CI 0·95—1·00)，阴性预测值为 0·95 (0·87—0·99)。 在两种小儿脑胶质瘤的配对样本中，在从低分级向高分级的转化中，UTSS 甲基化有所增加；在从局限性向转移性疾病进展的两种配对样本中，该甲基化也有所增加。 在八例 UTSS 高甲基化的非典型性乳头状瘤中，有两例进展为癌，而所评估的其他六例没有进展或不需要额外的治疗。 在 25 名 UTSS 超甲基化的后颅窝室管膜瘤患者中，5 年总生存率为 51% (95% CI 31—71)，在 20 名无超甲基化的肿瘤患者中该指标为 95% (86—100) (p=0·0008)。 在 25 名无 UTSS 超甲基化的肿瘤患者中，5 年无进展生存率为 86% (68—100)，而在肿瘤发生超甲基化的患者中该指标为 30% (10—50) (p=0·0008)。

结果解读
TERT 启动子中 UTSS 区域的超甲基化与癌症中的 TERT 表达相关。 在小儿脑瘤中，UTSS 超甲基化与肿瘤进展和不良预后相关。 该区域易于扩增，且用于确定超甲基化情况的检测可在大多数临床实验室中针对大部分组织进行。 因此，UTSS 区域是一个潜在的可用于多种癌症的生物标志物。 

Castelo-Branco P, Choufani S, Mack S, et al. Methylation of the TERT promoter and risk stratification of childhood brain tumours: an integrative genomic and molecular study. Lancet Oncol. 2013;14:534-42.