分析杆状体肌病的致病基因
2013-01-07 19:51:09   来源:37度医学网   作者:  评论:0 点击:

检测大片段的拷贝数变异的新工具

背景

杆状体肌病 (NM) 是一组异质性的先天性肌肉疾病,其特点为肌纤维中存在杆状体。 人们发现 7 个基因的突变具有 NM 致病性(NEBACTA1TPM2TPM3TNNT1CFL2KBTBD13 )。 NEB 是人类基因组中最大的基因之一,且目前已知 NEB 中的突变是隐性遗传性 NM 的主要原因。 虽然 NEB 基因中的大片段单缺失在德系犹太人群中较为典型,但该基因的大小和复杂性阻碍了对拷贝数变异的分析。 本文介绍了一种新的诊断工具,它可用于检测 NM 致病基因中大片段的拷贝数变异。

  • 本文介绍了一种新的定制型比较基因组杂交微阵列,即 NM-CGH,其中包含了 7 个参与 NM 病因的基因。
  • 微阵列包括内含子、外显子、内含子-外显子交界区以及基因的上游和下游序列。
  • 在于 2 个家系中进行的验证阶段中,研究人员鉴定了 NEB 中的 2 个新型缺失:一个包含 24 个外显子的大型缺失(约 53 kb),以及一个包含 2 个外显子小型缺失 (1 kb)。
  • 在所研究的家系中,研究人员发现其中 3 个家系中 NEB 的三次重复区域中存在拷贝数变异。

结论

作者总结道,NM-CGH 微阵列是“一种功能强大,符合成本效益且快速的工具,它可用于检测大片段的拷贝数变异,如巨大的 NEB 基因中的缺失和重复等。”

Kiiski K, Laari L, Lehtokari VL, et al. Targeted array comparative genomic hybridization – A new diagnostic tool for the detection of large copy number variations in nemaline myopathy-causing genes. Neuromusc Disord. 2012; doi:10.1016/j.nmd.2012.07.007.

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