分析杆状体肌病的致病基因
2013-01-07 19:51:09 来源：37度医学网 作者： 评论：0 点击：
检测大片段的拷贝数变异的新工具
背景
杆状体肌病 (NM) 是一组异质性的先天性肌肉疾病，其特点为肌纤维中存在杆状体。 人们发现 7 个基因的突变具有 NM 致病性（NEB 、ACTA1 、TPM2 、TPM3 、TNNT1 、CFL2 和 KBTBD13 ）。 NEB 是人类基因组中最大的基因之一，且目前已知 NEB 中的突变是隐性遗传性 NM 的主要原因。 虽然 NEB 基因中的大片段单缺失在德系犹太人群中较为典型，但该基因的大小和复杂性阻碍了对拷贝数变异的分析。 本文介绍了一种新的诊断工具，它可用于检测 NM 致病基因中大片段的拷贝数变异。
- 本文介绍了一种新的定制型比较基因组杂交微阵列，即 NM-CGH，其中包含了 7 个参与 NM 病因的基因。
- 微阵列包括内含子、外显子、内含子-外显子交界区以及基因的上游和下游序列。
- 在于 2 个家系中进行的验证阶段中，研究人员鉴定了 NEB 中的 2 个新型缺失：一个包含 24 个外显子的大型缺失（约 53 kb），以及一个包含 2 个外显子小型缺失 (1 kb)。
- 在所研究的家系中，研究人员发现其中 3 个家系中 NEB 的三次重复区域中存在拷贝数变异。
结论
作者总结道，NM-CGH 微阵列是“一种功能强大，符合成本效益且快速的工具，它可用于检测大片段的拷贝数变异，如巨大的 NEB 基因中的缺失和重复等。”
Kiiski K, Laari L, Lehtokari VL, et al. Targeted array comparative genomic hybridization – A new diagnostic tool for the detection of large copy number variations in nemaline myopathy-causing genes. Neuromusc Disord. 2012; doi:10.1016/j.nmd.2012.07.007.
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