Nature: 流感病毒的感染组学研究进展
2010-01-27 20:47:02 来源：丁香园 作者： 评论：0 点击：
前期Cell杂志刊登了流感病毒的感染组学研究进展。Nature也不甘居后，最近连续刊登两篇相似的文章。据我所知，还有其它大实验室也在做类似工作。看来这是当前的一个研究热点。这将大大地有助于研究流感病毒和宿主细胞的相互作用机制，由此有利于设计通用疫苗及开发抗流感药物。
首先，我们看看他们的研究手段有何不同。Burnham Institute 的策略如下：
来自德国Max Planck Institute的策略如下：
他们都有什么发现呢？
Burnham研究组利用RNAi手段，阐明了295个宿主细胞因子为流感病毒早期生活所必需。其中多是参与激酶调节信号转导、泛素化和磷酸化，181个因子对流感病毒和宿主细胞的相互作用至关重要。295个因子中的219个为野生型流感病毒增殖所必需，其中23个因子参与病毒穿入细胞过程，包括例如小泡或者V型ATP酶（vacuolar ATPase ，vATPase) ，有被小泡蛋白质家族（ COPI-protein families）, 成纤维细胞生长因子（fibroblast growth factor receptor ，FGFR)和 糖原合成酶激酶-3（glycogen synthase kinase 3 ，GSK3-β ）. 10种因子参与流感病毒穿入宿主细胞后事件，包括核穿入组分、蛋白酶和 钙/钙调素依赖蛋白激酶 （calcium/calmodulin-dependent protein kinase ，CaM kinase) IIβ (CAMK2B ). 值得注意的是，猪源H1N1流感病毒的增殖也依赖于这些因子。此外，作者还发现，一些宿主因子的小分子抑制剂，例如vATPase和CAMK2B的抑制剂，能够拮抗流感病毒。
Meyer小组也利用RNAi进行了筛选，确认了287个宿主因子与流感病毒的复制相关。其中，168个(59%)宿主因子与H1N1流行株(119个)及当前的猪源H1N1流行株 (121 个) 相关，两者重复性达60%，还有相当一部分因子与H5N1的致病性相关。对这些因子进行深度解析，可以发现它们与感染的相关性。 值得注意的是，SON DNA结合蛋白（SON DNA binding protein ，SON)3 在病毒感染早期时病毒在细胞内的移动和进入晚期内涵体相关。CDC样激酶分子-1（ CDC-like kinase 1 ，CLK1)4 能够将病毒的复制水平降低两个数量级，这可能与损伤了M2的信使RNA剪切相关。. 此外，利用周期素依赖性激酶1B的抑制剂作用于流感病毒感染的小鼠，能降低其肺部滴度，宿主因子与病毒致病的相关性由此可见一斑。
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【进展|热点】 Cell： 流感病毒-宿主细胞相互作用研究新进展
首先，我们看看他们的研究手段有何不同。Burnham Institute 的策略如下：
来自德国Max Planck Institute的策略如下：
他们都有什么发现呢？
Burnham研究组利用RNAi手段，阐明了295个宿主细胞因子为流感病毒早期生活所必需。其中多是参与激酶调节信号转导、泛素化和磷酸化，181个因子对流感病毒和宿主细胞的相互作用至关重要。295个因子中的219个为野生型流感病毒增殖所必需，其中23个因子参与病毒穿入细胞过程，包括例如小泡或者V型ATP酶（vacuolar ATPase ，vATPase) ，有被小泡蛋白质家族（ COPI-protein families）, 成纤维细胞生长因子（fibroblast growth factor receptor ，FGFR)和 糖原合成酶激酶-3（glycogen synthase kinase 3 ，GSK3-β ）. 10种因子参与流感病毒穿入宿主细胞后事件，包括核穿入组分、蛋白酶和 钙/钙调素依赖蛋白激酶 （calcium/calmodulin-dependent protein kinase ，CaM kinase) IIβ (CAMK2B ). 值得注意的是，猪源H1N1流感病毒的增殖也依赖于这些因子。此外，作者还发现，一些宿主因子的小分子抑制剂，例如vATPase和CAMK2B的抑制剂，能够拮抗流感病毒。
Meyer小组也利用RNAi进行了筛选，确认了287个宿主因子与流感病毒的复制相关。其中，168个(59%)宿主因子与H1N1流行株(119个)及当前的猪源H1N1流行株 (121 个) 相关，两者重复性达60%，还有相当一部分因子与H5N1的致病性相关。对这些因子进行深度解析，可以发现它们与感染的相关性。 值得注意的是，SON DNA结合蛋白（SON DNA binding protein ，SON)3 在病毒感染早期时病毒在细胞内的移动和进入晚期内涵体相关。CDC样激酶分子-1（ CDC-like kinase 1 ，CLK1)4 能够将病毒的复制水平降低两个数量级，这可能与损伤了M2的信使RNA剪切相关。. 此外，利用周期素依赖性激酶1B的抑制剂作用于流感病毒感染的小鼠，能降低其肺部滴度，宿主因子与病毒致病的相关性由此可见一斑。
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