11种遗传变异同2型糖尿病有关
2009-10-23 16:09:45 来源： 作者： 评论：0 点击：
密西根科技大学的数学家们开发出一些功能强大的新工具，可筛选出最顽固人类疾病的相关基因
利用其中一种，他们可以追溯数代定位遗传疾病的相关基因。利用另一种，他们已经分离出2型糖尿病相关基因中的11个变异，这种变异又称作单核苷酸多态性，SNP或者snps。
Qiuying Sha，一名数学副教授说，对于像帕金森，糖尿病和ALS这类的慢性疾病，多种基因与疾病发生有关。因此需要一种功能强大的检测手段。
这种手段就是ELA，ELA是一种可以检测一组SNPs的软件，SNPs对疾病具有显著影响。
对于包括2型糖尿病在内的复杂遗传病，单个基因即可能促使疾病发生，但其他基因一起作用时就可能发病。过去，由于在人类基因组约500,000个基因中通过计算匹配可疑基因基本不可能，因此发现基因组合极度困难。
ELA避开了这个问题，首先它极大缩小了潜在危险基因的范围，其次，通过统计方法检测哪些SNPs独立发挥作用，哪些协同发挥作用。她说：我们认为这种技术棒极了。
为了检测真实数据模型，Sha的团队对来自英国的1,000人（其中一半患2型糖尿病，另一半未患）的基因进行了分析。他们发现了11个SNPs，单独或成对的同2型糖尿病的发生可能高度相关。他们的工作成果被发表在基因流行病学杂志上。
ELA被用来比较不相关个体的基因组成，以筛选出疾病相关基因。该团队还开发出另一种技术，TTFP，利用结合创建者表型的两步骤相关性测试，对回溯数代的家族成员基因组进行检测
过去，研究者已经对核心家庭（包括父母，子女）做过研究。但是TTFP这种技术可以回溯到祖父母，曾祖父母，你想多少代都行。
关于TTFP的研究结果发表于欧洲人类基因杂志上。
现在他们已经开发出简化分析步骤的软件，Sha说。但获取基因资料并不是件容易事，她很困恼地说：我们目前还没有可供处理的数据资料，这就是没有医学院产生的问题。
对于拥有数据的人或单位，该小组的软件可能帮助他们找到疾病相关基因。ELA的Windous和Linux版本可在http://www.math.mtu.edu/~shuzhang/software.html获取，TFFP如果要求也可以获得
利用其中一种，他们可以追溯数代定位遗传疾病的相关基因。利用另一种，他们已经分离出2型糖尿病相关基因中的11个变异，这种变异又称作单核苷酸多态性，SNP或者snps。
Qiuying Sha，一名数学副教授说，对于像帕金森，糖尿病和ALS这类的慢性疾病，多种基因与疾病发生有关。因此需要一种功能强大的检测手段。
这种手段就是ELA，ELA是一种可以检测一组SNPs的软件，SNPs对疾病具有显著影响。
对于包括2型糖尿病在内的复杂遗传病，单个基因即可能促使疾病发生，但其他基因一起作用时就可能发病。过去，由于在人类基因组约500,000个基因中通过计算匹配可疑基因基本不可能，因此发现基因组合极度困难。
ELA避开了这个问题，首先它极大缩小了潜在危险基因的范围，其次，通过统计方法检测哪些SNPs独立发挥作用，哪些协同发挥作用。她说：我们认为这种技术棒极了。
为了检测真实数据模型，Sha的团队对来自英国的1,000人（其中一半患2型糖尿病，另一半未患）的基因进行了分析。他们发现了11个SNPs，单独或成对的同2型糖尿病的发生可能高度相关。他们的工作成果被发表在基因流行病学杂志上。
ELA被用来比较不相关个体的基因组成，以筛选出疾病相关基因。该团队还开发出另一种技术，TTFP，利用结合创建者表型的两步骤相关性测试，对回溯数代的家族成员基因组进行检测
过去，研究者已经对核心家庭（包括父母，子女）做过研究。但是TTFP这种技术可以回溯到祖父母，曾祖父母，你想多少代都行。
关于TTFP的研究结果发表于欧洲人类基因杂志上。
现在他们已经开发出简化分析步骤的软件，Sha说。但获取基因资料并不是件容易事，她很困恼地说：我们目前还没有可供处理的数据资料，这就是没有医学院产生的问题。
对于拥有数据的人或单位，该小组的软件可能帮助他们找到疾病相关基因。ELA的Windous和Linux版本可在http://www.math.mtu.edu/~shuzhang/software.html获取，TFFP如果要求也可以获得
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